この記事の要点
- 夜勤手当・深夜割増は、ふつうの給与として課税されます。社会保険料を決める「報酬」にも入ります。
- 非課税の特例があるのは「宿直料・日直料」(1回4,000円まで、条件あり)で、交代制の夜勤とは別物です。
- 4〜6月の報酬(夜勤手当を含む)の平均で、9月から1年間の社会保険料が決まります(定時決定)。
- 2026年4月から、夜食代(現金)の非課税枠は1回650円に、食事の現物支給は月7,500円に上がりました。
- 住宅手当(現金)は課税。会社が用意する寮で、本人が賃貸料相当額の50%以上を払っていれば差額は非課税です。
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夜勤明けにもらう給与明細。夜勤手当の欄を見ながら、「これにも税金がかかっているのかな」と思ったことはありませんか。
結論から書くと、夜勤手当はふつうの給与として課税され、社会保険料の計算にも入ります。ただ、似たような名前の「宿直料」には非課税の特例があり、2026年4月には夜食代や食事の非課税枠も変わりました。国税庁と日本年金機構の資料をもとに、医療職の給与明細に出てくる手当を整理します。
手当ごとの扱い早見表
| 手当・給付 | 所得税・住民税 | 社会保険料の計算 |
|---|---|---|
| 夜勤手当・深夜割増・残業代 | 課税 | 報酬に入る |
| 宿直料・日直料 | 1回4,000円まで非課税(条件あり) | 報酬に入る |
| 通勤手当(電車・バス) | 月15万円まで非課税 | 全額が報酬に入る |
| 通勤手当(車・自転車) | 距離に応じた額まで非課税 | 全額が報酬に入る |
| 住宅手当(現金) | 課税 | 報酬に入る |
| 寮・社宅 | 本人負担が賃貸料相当額の50%以上なら差額は非課税 | 都道府県ごとの価額で報酬に換算 |
| 食事の現物支給 | 本人が半分以上負担し、会社負担が月7,500円以下なら非課税 | 都道府県ごとの価額で報酬に換算 |
| 深夜勤務の夜食代(現金) | 1回650円以下なら非課税 | 編集部では未確認 |
ポイントは、税金で非課税でも、社会保険料の計算には入るものが多いことです。代表的なのが通勤手当で、所得税では一定額まで非課税ですが、社会保険では全額が「報酬」に含まれます。
夜勤手当と宿直料は、別のもの
所得税には、宿直・日直の手当を1回4,000円まで非課税にする特例があります(所得税基本通達28-1)。ただしこれは、ふだんの仕事とは別に、ほとんど待機しているような宿直・日直を想定したものです。次の場合は全額が課税されます。
- 通常の勤務時間の中で行った宿直・日直
- 宿直・日直のかわりに代休が与えられる場合
- 給与の額に比例して宿直料が決まる場合
看護師や介護職の交代制の夜勤は、通常の勤務そのものです。夜勤手当や深夜割増(22時〜5時の割増賃金)に、この特例は使えません。オンコール手当・待機手当がどちらに当たるかは個別の判断になり、編集部では一般化できる資料を確認できていません。
4〜6月の夜勤が、1年間の保険料を決める
厚生年金と健康保険の保険料は、「標準報酬月額」をもとに計算します。この額は毎年、4月・5月・6月の報酬の平均で決まり、9月から翌年8月まで使われます(定時決定)。報酬には、夜勤手当・残業代・通勤手当も含まれます。
つまり、4〜6月に夜勤が多いと、その後1年間の保険料が上がります。ただしそのぶん、将来の厚生年金や、病気・出産で休んだときの傷病手当金・出産手当金の計算のもとになる額も上がります。損か得かは一概に言えません。
夜勤の回数が変わっただけでは、原則として年の途中の見直し(随時改定)の対象になりません。夜勤手当は勤務の実績で変わる手当なので、定時決定で反映されるのが基本です。
出典: 日本年金機構「厚生年金保険の保険料」(2026年9月確認)
2026年4月に変わったこと:夜食・食事・通勤
夜食代と食事の非課税枠が上がった
- 深夜勤務の夜食代(現金):非課税になる上限が1回300円から650円に(2026年4月1日以後)。
- 食事の現物支給:本人が食事の価額の半分以上を払い、会社の負担が月7,500円(税抜)以下なら非課税。以前は月3,500円でした(2026年4月1日以後に支給する食事から)。
- 残業や宿日直のときに出す食事は、無料でも非課税です。
出典: 国税庁「食事の現物支給に係る所得税の非課税限度額の引上げについて」(2026年)、タックスアンサー No.2594
車・自転車通勤の非課税枠が広がった
電車・バスの通勤手当の非課税限度額は月15万円のままです。車・自転車の通勤は、2025年に距離10km以上の区分の額が引き上げられ、2026年4月1日以後に支払う分からは、片道65km以上の区分が細かくなり(95km以上で月66,400円)、条件を満たす駐車場代も月5,000円まで上乗せできるようになりました。地方で車通勤をしている人に関係する改正です。
出典: 国税庁 タックスアンサー No.2585(2026年4月1日現在法令等)
「寮あり」と「住宅手当あり」は、手取りへの効き方が違う
求人票でよく見る「寮あり」と「住宅手当あり」。似ているようで、税金の扱いが違います。
- 住宅手当(現金):全額が課税されます。本人が自分で家を借りて、病院が家賃を補助する形も、住宅手当の扱いです。
- 病院が用意する寮・借り上げ社宅:本人が「賃貸料相当額」(固定資産税の課税標準額などから計算する額)の50%以上を払っていれば、差額は非課税です。国税庁は、看護師など勤務場所を離れて住むことが難しい人に、仕事の都合で貸す寮は、無償でも非課税になる場合があるとしています。どの寮が当てはまるかは個別の判断です。
社会保険では、寮や食事は都道府県ごとに決められた「現物給与価額」で報酬に換算されます。住宅の価額は2026年10月1日から、1畳あたりではなく総面積1㎡あたりで計算する方式に変わります。
出典: 国税庁 タックスアンサー No.2597、日本年金機構「令和8年4月から現物給与の価額が改正されます」(2026年)
パートで夜勤をする人は、年収の壁にも注意
夜勤手当や深夜割増は、税の収入にも、社会保険の扶養(130万円)の見込み年収にも入ります。1回の勤務時間が長い夜勤は、日数で調整していると、月の時間数がすぐに増えます。詳しくは2026年の年収の壁まとめをご覧ください。
見学のときに聞いておきたいこと
日本看護協会の2025年の調査では、定額の夜勤手当は2010年以降ほぼ横ばいだとされています。夜勤手当の額は職場によって違うので、求人を比べるときは次の点を確かめておくと安心です。
- 夜勤手当は1回いくらか2交代と3交代で額が違うか。深夜割増とは別に出るのか。
- 月の夜勤回数の実績予定ではなく実績。4〜6月に偏りがないか。
- 夜食・食堂夜勤中に食事が出るか、自己負担はいくらか。
- 寮か住宅手当か寮なら自己負担額、住宅手当なら支給の条件と上限。
協会けんぽと日本年金機構の扱いをもとに書いています。健康保険組合や共済組合(公立病院など)では、扱いが違う場合があります。オンコール手当、奨学金の返済手当、資格取得費用の補助などの扱いは、編集部では確かめられていない部分があります。具体的な判断は、勤め先の給与担当や税務署にご確認ください。
出典・参考資料
- 所得税基本通達28-1(宿直料又は日直料)(国税庁、2026年9月確認)
- タックスアンサー No.2594 食事を支給したとき(国税庁、2026年)
- 食事の現物支給に係る所得税の非課税限度額の引上げについて(国税庁、2026年)
- タックスアンサー No.2597 使用人に社宅や寮などを貸したとき(国税庁、2026年)
- タックスアンサー No.2582・No.2585 通勤手当(国税庁、2026年)
- 厚生年金保険の保険料(日本年金機構、2026年9月確認)
- 令和8年4月から現物給与の価額が改正されます(日本年金機構、2026年)
- 「2025年 病院看護実態調査」結果(日本看護協会、2026年)
この記事は2026年9月25日時点で確認できた資料にもとづいて書いています。制度や数字は変わることがあります。手続きや判断の前に、勤務先・税務署・年金事務所・自治体などの最新の案内をご確認ください。